A Pontoglio con i suoi uomini. Con altri condottieri (500 cavalli leggeri) attacca alla retroguardia 1000 cavalli leggeri e 300 lance comandati da Giovanni dei Medici. E’ sconfitto e fatto prigioniero con Annibale di Lenzo e 120 cavalli leggeri.

Si muove nel pavese;  affianca Giovanni Naldi all’assedio di Garlasco:  cattura in un’  imboscata 60 archibugieri e 30 cavalli (su 50) usciti nottetempo dal castello per una sortita. Con Giulio Manfrone affronta Renzo di Ceri nei pressi di Sartirana Lomellina; dopo qualche giorno con Paolo Luzzasco, Luigi Gonzaga e Giovanni Naldi sorprende a Scaldasole Pirro Gonzaga da Bozzolo, che con 80 uomini d’arme e 150 cavalli leggeri sta tentando di tagliare le linee di vettovagliamento all’ esercito veneziano. Nel combattimento viene catturato Cesare Pioli con 250 uomini. Il Malatesta da Sogliano prosegue nella sua azione fin sulle porte di Vigevano.

Giunge nel pavese; con Luigi Gonzaga respinge un attacco proveniente da Milano, che termina con la cattura di alcuni cavalli.

Si reca a Ravenna per raccogliervi fanti per conto del della Rovere. Raggiunge Carpi con 1200 fanti e da qui si sposta alla difesa di Verona. Ha il comando di un colonnello;  con 650 fanti sorveglia il tratto delle mura intercorrente tra Porta Vescovo ed il castello di San Felice.

Viene trasferito alla guardia di Bergamo al posto di Mercurio Bua;  con i suoi fanti prende alloggio nella città. Ha il compito di seguire le opere di rafforzamento legate alle difese cittadine e di contrastare nelle vallate del bergamasco l’azione di Gian Giacomo dei Medici.

Ha ai suoi ordini anche 60 cavalli leggeri. Si sposta a Cremona;  numerosi  fanti delle sue compagnie muoiono di peste nella città. Nonostante i molti disagi dovuti al ritardo delle paghe ed alle malattie affianca Roberto da San Severino nell’ alessandrino; con tale condottiero va  incontro ai rinforzi francesi condotti dal Saint-Pol. Assale con Giovanni Naldi Sant’Angelo Lodigiano: fa iniziare il bombardamento della fortezza dopo l’uccisione del Naldi; Sant’Angelo Lodigiano viene espugnata e messa a sacco.

E’ inviato con Lucantonio Cuppano (tutta la cavalleria, 1200 fanti e 4 pezzi di artiglieria) sulle sponde veneziane dell’Adda sia per sorprendervi alcune compagnie di fanti spagnoli comandate da Cesare da Napoli, sia per distruggere un ponte di barche allestito dagli imperiali a Trezzo sull’Adda. Gli avversari, informati della sua incursione, riattraversano subito il fiume e distruggono il ponte.

Alla morte del padre Ramberto prende le armi contro i fratelli perché uno di essi, Galeotto, si è impossessato di Rocca di Pondo. Il commissario pontificio della Romagna, Baccio Valori, impone alle parti di deporre le armi: il Malatesta da Sogliano deve riconoscere a ciascun fratello una rendita annua di 800 ducati e consegnare loro San Giovanni in Galilea e la rocca di San Martino in Converseto.

A Ghedi, alla mostra degli uomini d’arme del della Rovere. Prende parte ad un’esercitazione in cui ha il comando di una squadra; in essa uomini d’arme e cavalli leggeri si cimentano in combattimento.

Ha gravi contese con il figlio Giovanni Battista a causa del suo amore con la nuora Virginia Accolti: lo scaccia e gli sequestra la dote ed i beni della donna.

Nominato capitano del Friuli, apprende da alcuni parenti che è stato emesso dai pontifici un ordine di cattura nei suoi confronti: l’accusa è di avere fatto avvelenare la moglie e di avere fatto sgozzare una cameriera, colpevole di avere divulgato il suo legame con la nuora.

Su accusa del fratello Galeotto è condannato a morte dal commissario pontificio della Romagna; gli è comminata una multa di 20000 ducati e gli sono confiscati i beni; la nuora  è condannata al carcere perpetuo. Il  Malatesta da Sogliano ripara a Venezia ed a Mantova  dove i Gonzaga gli garantiscono piena sicurezza.

Muore a Mantova.  Nel 1561 il fratello Galeotto, incarcerato a Volterra, confesserà di avere indotto il nipote Giovanni Battista ad accusare il padre.