Fa ribellare Lecce: nella città perseguita i partigiani del duca di Camporosso che hanno favorito i francesi. Molti sono i condannati al remo delle galere.

Assedia in Taranto Giorgio di Silly con la sua galea, 7 galee veneziane e 4 barche biscagline provenienti da Brindisi. Si ferma sei settimane davanti all’isola di Nostra Signora in attesa del resto della flotta della Serenissima; raggiunto da  altre 19 galee veneziane ha il comando delle operazioni. Blocca l’approvvigionamento alla città dal mare.

Si trova a Brindisi. Il governatore veneziano della città Giorgio Lion non gli dà il  permesso di prendere una galea bloccata nel porto appartenente  ad un fratello.

Fa pressioni sul re di Napoli  affinché sia dato il guasto agli oliveti di Monopoli per provocare una rivolta della popolazione contro i veneziani. Raccoglie a Lecce denaro e truppe per gli aragonesi.

E’ nominato governatore di Taranto. Con il conte di Potenza Antonio di Guevara, tutore del figlio del re Federico d’Aragona, viene assediato nella città da Consalvo di Cordoba. Perde ogni speranza di una difesa efficace allorché gli spagnoli riescono a trasferire una flottiglia nel Mar Piccolo.

Si arrende a patti al  Cordoba alla condizione di non ricevere soccorsi entro quattro mesi. Al termine stabilito consegna la città e la rocca: il duca di Calabria è condotto in Spagna nonostante le promesse precedenti.

Con Fabrizio Colonna ispeziona il campo del la Palisse che con 200 lance e 300 arcieri a cavallo sta per congiungersi nei pressi di Barletta con il duca di Nemours.

Partecipa alla battaglia del Garigliano dove si segnala per la furia con la quale assale i francesi. E’ inviato con 700/800 cavalli leggeri e stradiotti e 300 fanti ad Andria per liberare la città dall’assedio che vi è stato posto da Luigi d’Ars. Giuntovi rapidamente attacca il campo avversario e vi penetra nonostante il fuoco dell’ artiglieria: interviene la cavalleria francese che lo respinge con forti perdite tra i suoi. Tutti i fanti e molti cavalli sono uccisi o fatti prigionieri.

Salpa dalla Puglia e si reca a Venezia; passa al soldo della Serenissima per combattere le truppe della lega di Cambrai. Dà in prestito 4000 ducati ai veneziani come apporto  alle spese di guerra e se ne tiene altri 1000 per le sue necessità.

Raggiunge il campo di Garliano ben accetto a Bartolomeo d’Alviano che stima la sua combattività. Gli viene riconosciuta una provvigione annua di 400 ducati, una condotta di 150 balestrieri a cavallo (100 nella realtà) ed è nominato governatore dei cavalli leggeri. Passa alla guardia di Brescia. Dopo la rotta di Agnadello perlustra le rive dell’Oglio con il provveditore Niccolò Marcello al fine di sorvegliare i movimenti dei francesi.

Segue Niccolò Orsini nella sua ritirata verso est, guada il Brenta a Sambruson e si accampa a Mestre. Si sposta a Castelfranco Veneto e vi fronteggia i filoimperiali: si reca, da ultimo, a Venezia nel Collegio dei Pregadi.

Lascia Mestre e si porta a Treviso con il provveditore generale Andrea Gritti; ritorna verso Castelfranco Veneto con 1500 cavalli e 1000 fanti, cavalca su Cittadella dove si sta radunando l’esercito nemico; è a Conegliano e prende il posto di Lucio Malvezzi, a Padova. Con Pietro Corso e Giovanni Brandolini espugna la fortezza di Serravalle (Vittorio Veneto) dopo avere  sconfitto i tedeschi di Rodolfo di Anhalt (800 morti tra gli avversari); entra in Belluno e perseguita con vigore i nemici in fuga. Passa alla difesa di Padova quando la città viene recuperata.

Accoglie a Padova i figli del doge Alvise e Bernardo Loredan, giunti alla difesa della città con molti altri nobili veneziani.

Al termine dell’ assedio di Padova si reca a Venezia;  nel Collegio non si esprime a favore di un’azione offensiva su Vicenza perché (come puntualmente si verificherà), una volta conquistata, i  veneziani non sono in grado di difendere con efficacia la città. Si sposta a Soave con il provveditore Andrea Gritti per attaccare Verona.

Giunge a Lonigo;  si allontana dalla località alla notizia che da Verona sono uscite molte truppe; sorprende 200 fanti spagnoli che si sono spinti per il saccomanno sino a Colognola ai Colli. Li coglie in disordine e tutti i nemici sono uccisi o fatti prigionieri. Invia 30 stradiotti ad attraversare l’Adige per attaccare gli imperiali alle spalle; si scontra con costoro su un ponte a San Martino Buon Albergo ed infligge loro numerose  perdite. Nel combattimento (in cui riporta due ferite alla testa) sono catturati Carlo  Baglioni, il tedesco Cletense e Sagramoro Visconti con 50 uomini d’arme e 200 cavalli leggeri italiani; vi perdono la vita 60 balestrieri a cavallo. Con Niccolò Orsini, il Malvezzi e Giano Fregoso ha una nuova scaramuccia verso Soave con 1500/2000 fanti guasconi e spagnoli; fra Leonardo Prato ha la meglio, fa prigionieri molti soldati compresi 50/60 cavalli leggeri dei saccomanni. A fine mese ha l’incarico di opporsi ad una nuova incursione di truppe nemiche uscite da Verona; gli stradiotti non vogliono  seguirlo; il Prato non se ne dà per inteso e con le lance ed i fanti si porta a Villanova dove si scontra con un grosso contingente di lance, cavalli leggeri e 1000 fanti con quattro falconetti comandati da Giovanni Gonzaga e da Federico Gonzaga da Bozzolo. Attacca sui monti gli avversari con i suoi balestrieri a cavallo: sono uccisi più di 150 uomini tra spagnoli, borgognoni ed italiani e sono catturati 100 cavalli tra i  quali vi sono 40 armigeri borgognoni. Per tutte queste imprese il Consiglio dei Savi gli aumenta la provvigione annua di 200 ducati ed è concessa una provvigione mensile di 10 ducati ai nipoti Mariano da Lecce e Giovanni Bernardino da Lecce.

A San Bonifacio per un consiglio di guerra con i provveditori: si prevede  che i francesi attacchino nel Polesine. I veneziani ripiegano; il  Prato ne protegge la ritirata a Caldiero, a Longare (dove alloggia nelle case dei Trissino con Lucio Malvezzi e Giano Fregoso) e Montebello Vicentino. Si trasferisce nottetempo con 400 balestrieri a cavallo a Vo per verificare le possibilità logistiche di uno spostamento del campo da Vicenza a Padova. Quando Monselice viene assalita dai francesi interviene a sua difesa con 300 cavalli, 500 fanti e 500 stradiotti; ritorna nella località giorni dopo con 200 cavalli per controllarvi lo stato delle fortificazioni; con Antonio Pio preme sui veneziani per un’azione diversiva ai danni degli estensi.

Al campo di Brentelle. Legnago è conquistata dagli avversari; il Prato si avvia verso Cittadella con 400 balestrieri a cavallo, 200 stradiotti e 1000 fanti agli ordini di Giovanni dal Borgo; attraversa il Brenta al ponte di Vigodarzere, prosegue per Camposampiero e Castelfranco Veneto; rientra nella bassa padovana e sorveglia le strade verso Monselice. Si ferma alla difesa di tale città, ne ispeziona le opere difensive con il provveditore Andrea Gritti, Giampaolo Manfrone, Dionigi Naldi, Giovanni dal Borgo ed arriva a risultati sconfortanti. E’ favorevole alla nomina del  Malvezzi come governatore generale.  Si trova creditore verso la Serenissima di 2000 ducati per paghe arretrate.

Propone di rafforzare le difese di Padova minacciata dai francesi;  è segnalato a pranzo con il capitano nemico Andrea da Capua. Si muove di seguito in avanscoperta con il Manfrone per spiare i movimenti dei nemici stanziatisi tra Santa Croce Bigolina, San Pietro in Gu, Longara, Mestrino e Montegalda. Ritorna a Monselice per controllare il morale dei difensori ed ha un colloquio con un trombetta di Andrea da Capua che, forse, si offre di  militare con i veneziani. Si colloca alla guardia del Bassanello a Padova;  con la caduta di Monselice effettua vari giri di ispezione verso tale centro. I francesi ripiegano: con il provveditore Sigismondo Cavalli esce da Padova con 1000 cavalli leggeri e tallona i nemici verso Torre, Trissino, Arzignano e Montebello Vicentino.

E’ prima a Bassano del Grappa e poi nel Polesine alla testa di 600 cavalli leggeri. Con Meleagro da Forlì decide di costruire un ponte a Boara Pisani; conquista Castelbaldo dove si appropria di 500 stera di orzo che sono consegnati ai suoi uomini; muove su Ficarolo e ne chiede la resa; perviene a Papozze e vi si congiunge con il capitano del Po Marco Antonio Contarini. Tocca Polesella ed il bastione di Crespino ove costruisce un ponte di barche; supera il Po e porta il terrore nel ferrarese.

I suoi uomini sono accusati di avere messo a sacco Polesella. Dimostra la loro estraneità e trova che i colpevoli sono da annoverare nei venturieri di Bartolomeo dalla Barba. Con Meleagro da Forlì fa presente ai veneziani i pericoli insiti nell’offensiva nel Polesine; si sposta a Ficarolo con 200 cavalli. Alla notizia che gli estensi stanno attraversando il Po a Francolino ordina di incendiare i mulini e di ritirarsi su Ponticchio. Molti dei suoi balestrieri a cavallo (307) si danno allo sbando; nonostante ciò con 50 cavalli respinge 40 fanti che hanno superato il fiume. Costruisce un nuovo ponte di barche a Ponticchio e rientra a Polesella. Il suo ruolo nella campagna viene ritenuto insostituibile. Anche se i suoi uomini non ricevono da tempo la loro paga fra Leonardo Prato riesce a galvanizzarli;  con i suoi 50 cavalli e, la collaborazione di popolani armati imbarcati su piccoli navigli, riesce a recuperare Adria. Sempre nel periodo è l’ unico tra i condottieri che accetta che i suoi cavalli leggeri siano pagati personalmente dal provveditore di Rovigo Silvestro Pisani. Gli è dato il comando delle milizie che stazionano nel Polesine; giunge a Badia Polesine con 200 cavalli per prevenirvi un possibile attacco degli estensi. Gli vengono contro 300 lance francesi ed italiane, 300 cavalli leggeri e 200 fanti: fa distruggere il ponte di barche ed abbandona Adria. Si ritira a Montagnana e recupera poco dopo il Polesine con il provveditore Giovanni Diedo. Raggiunge Ponticchio e vi ricostruisce il ponte di barche.

Affianca il provveditore generale Paolo Capello per prestare soccorso  ai pontifici. Fa costruire a Canda un ponte per attaccare Ficarolo; è a Stellata con Chiriaco dal Borgo al comando dell’ avanguardia.  Da qui si trasferisce nel modenese.

Partecipa ad un consiglio di guerra a Bologna con Antonio Pio, Fabrizio Colonna, Giampaolo Baglioni, Giovanni da Sassatello, Raffaello dei Pazzi, Francesco Maria della Rovere: rientra a San Cesario sul Panaro.

E’ sempre nei pressi di Mirandola per tendere insidie ai francesi. Si avvia verso Revere dove sono accampati gli avversari; giunge a Bellaria sul Secchia con 40 cavalli leggeri; entra in un palazzo per scaldarsi.  Vi è sorpreso dalla cavalleria di Gian Giacomo da Trivulzio e del Boissy (300 lance e 600 cavalli leggeri). Esce con gli altri dal palazzo; viene intercettato da una squadra francese. Rifiuta la resa, è ferito alla testa dal Conty e cade a terra morto. A settembre sarà sepolto con tutti gli onori a Venezia nella chiesa dei Santi Giovanni e Paolo. Suo busto nella villa comunale di Lecce, città in cui gli è stata dedicata anche una via centrale. A fra Leonardo Prato si deve la costruzione, sempre a Lecce, dell’arco che da lui ha preso il nome, “Arco di Prato”, che si affaccia su una piazzetta dove sorge l’omonimo suo palazzo. Per i suoi meriti tale edificio sotto il dominio aragonese  godette del diritto di asilo.